Non è vero :P
Google oggigiorno indicizza bene sia i contenuti degli swf sia i parametri degli FLV.
ci sono vari modi di ottimizzare il SEO con flash.. e in rete si trova di tutto ^^
per le immagini ipotizzo che banalmente non hai attivato l'"allow smoothing" dalla libreria di flash, quindi:
Apri la libreria.. seleziona il file che hai importato, doppio click.. e spunta la casella Allow Smoothing (in italiano non lo so

).
Dovrebbe bastare... se cosi' non è.. il problema sta alla fonte del files..
ma puoi provare a impostare sempre dalla libreria su Loseless (senza perdita) o pompare la compressione Jpg dalle opzioni di pubblicazione.